申通物流的网站建设,平度网站建设公司电话,专业企业网站搭建推荐,门户网站建设合同写在前面四五年前#xff0c;接触生物信息的时候#xff0c;阴差阳错#xff0c;我选择用perl。事实上#xff0c;直到嫌我#xff0c;我还是认为我当初的选择#xff0c;完全正确#xff01;。在做一些小文本的快速处理上#xff0c;perl在我看来#xff0c;从来最优…写在前面四五年前接触生物信息的时候阴差阳错我选择用perl。事实上直到嫌我我还是认为我当初的选择完全正确。在做一些小文本的快速处理上perl在我看来从来最优最快当然进步往往来自于颠覆如果你不革自己的命那么自然有人来革了你的命。进入博士课题组之后我们整体商量最后定下来课题组的官方编程语言为Python(当时我强烈建议使用python)。原因有很多但是perl毕竟是perlpython是目前做生信简单数据分析比较受推荐的语言。所以最后我还是要写python (而且是要把之前一些用java写的代码用python重新写一遍....)python码码环境准备以前写Perl一开始使用txt写后来用notepad也用了一段时间的vim不过整体上目前也没有变化了就是直接notepad。python号称是面向对象。一个面向对象的语言如果不用IDE似乎不是太好。所以最后决定就用pycharm。下载与安装python环境直接在python官网下载并安装对应的python版本这块我之前已经安装好了。image.png安装起来应该是不断下一步就不会有问题。下载与安装pycharm进入官网点击下载image.png选择社区版毕竟我暂时不搞Web不需要使用专业版image.png下载完了双击文件进行安装image.pngimage.png中间有很多设置我基本都保持默认随后看到一个感觉很不错的特点似乎支持很多语言image.pngvim整体上我用得挺多不过并不是太熟悉。在windows下鼠标来得实在所以就不勾选了。但是R语言的支持 bash的markdown的还是选上。安装基本完成我创建了一个项目叫做sRNApy。一顿下一步感觉还不错。不过似乎找不到R环境。image.png那么一定是在设置之类的地方就可以导入R编译器(当然导入之前需要自己先安装好R)image.pngimage.png随后等待pycharm构建一些索引可能是用于语法高亮image.png然后关闭重启似乎就可以了环境配置就这样吧先来一段题外话因为我还是比较关心。是否pycharm可以从某个层面上来说替代Rstudio毕竟有时候Rstudio用着不是太顺手。试了一下感觉还可以image.png而且还可以自动保存PDF...image.png可能稍微配置一下就可以像Rstudio一样了。然而这个不是主题不整了。删掉R脚本开始正式的python码码生活
